کلیسای سنت توماس (آلمانی: Thomaskirche) کلیسای لوتری در لایپزیک آلمان است. مشهورترین آن جایی است که یوهان سباستین باخ از سال 1723 تا زمانی که در سال 1750 درگذشته بود و به عنوان محل اقامت او کار میکرد.کلیسا در محل فعلی Thomaskirche از قرن 12th وجود دارد. بین 1212 و 1222 کلیسای پیشین به کلیسای جدید سنت توماس از نظم آگوستینز تبدیل شد. در 1217، مینزینگر، یا ترابادور (مینزنگ را ببینید)، هاینریش فون مورنگن به کلیسا از سنت توماس پس از سفر به هند وارد حکومت قناری شد. پس از چند بازسازی (باقی مانده از کلیسای قبیله ای رومانسک در کاوش های باستان شناسی یافت شد.