داستان در سری Rainbow Six اهمیت بسیار کمی دارد. تقابل نیروهای ضدتروریستی با تروریستها برای نجات گروگان و یا خنثیسازی بمب، تنها روایت مختصری از داستان است که فقط زمینهای برای ارایه یک گیمپلی جذاب به شمار میروند. در Siege داستان در مورد تقابل گروه رینبو با نیروهای «White Masks» است که هویتی نامشخص دارند و در سراسر جهان به خرابکاری میپردازند. اهمیت کمتر داستان در آخرین نسخه پررنگتر نیز شده و از آنجایی که شاهد یک اثر مبتنی بر همکاری تیمی و بازی چندنفره هستیم، داستان کم اهمیتترین عنصر بازی به شمار میرود. ولی گیمپلی جایی است که Siege حرفهای زیادی برای گفتن خواهد داشت.