در مخزن سپتیک تانک باکتری های بی هوازی با استفاده از مواد آلی موجود در فاضلاب شروع به رشد و نمو کرده و مواد غذایی موجود در فاضلاب را به عنوان غذا مصرف کرده و از بار آلودگی فاضلاب می کاهند لجن های موجود در فاضلاب پس از مدتی شروع به ته نشینی میکنند که این لجن های اضافی و مازاد بایستی در بازه های زمانی معین از مخزن تصفیه گردد.