در ابتدا مشهد روستایی به نام ساناباد (که به نام نوقان نیز خوانده می شده) بوده است،امام هشتم شیعه اسلام، در ساناباد دفن شدند. امام رضا تنها امام است که در خاک ایران دفن شده و اعتقاد بر این است که با مسمومیتشهید شدند و نام شهر به معنی "محل شهادت" است.این شهر آسیب های فراوانی در زمان حمله مغولها به ایران دید و خرابی های زیادی به بار امده بود بیشترین خرابی ها مربوط به سوختن کتابهای مهمی بود که بزرگترین دانشمندان به جمع آوری آنها پرداخته بودند.