شامپانزهها همانند گوریلها، انسانها و اورانگوتانها عضوی از خانوادهٔ انسانساییان هستند. شامپانزهها حدود 6 میلیون سال پیش از فرگشت انسان جدا شدهاند،
و در حال حاضر دو گونه شامپانزهٔ موجود نزدیکترین خویشاوندان زندهٔ انسانها هستند. دو گونهٔ شامپانزهٔ معمولی و بونوبو (شامپانزهٔ کوتوله) نزدیک به 1 میلیون سال پیش از هم جدا شدهاند.