با ورود فاضلاب به سپتیک تانک پلی اتیلن این فاضلاب ته نشین شده و مدتی آرام در سپتیک تانک پلی اتیلن باقی می ماند . در این مدت در داخل مخزن سپتیک تانک باکتری های گرم منفی و میکروارگانیسم های موجود فاضلاب شروع به فعالیت می کنند . داخل سپتیک تانک به نحوی طراحی شده تا اکسیژن در کمترین حد باشد. محیط آرام و بدون نور باعث آغاز فعالیت بی هوازی باکتری های (بی هوازی) میگردد . بعد از مدتی تعداد باکتری ها زیاد شده و باکتری ها به دنبال منبع انرژی شروع به حل کردن و خوردن جامدات فاضلاب می نمایند . سپس جامدات فاضلاب به نحوه چشم گیری کاهش و تعداد باکتری ها بسیار زیاد می گردند . این باکتری ها برای تهیه منبع انرژی جدید به باکتری های ضعیف تر حمله و آنها را از بین می برند به عبارتی در درون سپتیک تانک پلی اتیلن خودخوری باکتریایی صورت می پذیرد . این عمل باعث تولید مایعی سبز از فاضلاب می گردد که حاصل کشته شدن میلیاردها باکتری می باشد. کار سپتیک تانک تمام شده است آب رقیق شده از بافل (دیواره جدا کننده داخل سپتیک تانک ) سر ریز شده و وارد بخش دوم سپتیک تانک میگردد . در این بخش مواد آبکی شروع به خروج از فلنچ خروجی میکنند . این فلنج ها در مکان یک سوم انتهایی از سپتیک تانک پلی اتیلن قرار دارند تا بیشترین کارایی را داشه باشند .